
Zarówno w naszym wnętrzu jak i w otaczającym nas środowisku bytują mikroorganizmy niewidoczne gołym okiem. Są to bakterie, wirusy, grzyby, archeony i eukarionty. Wpływają one na naszą fizjologię, przyczyniając się do wzmocnienia lub osłabienia funkcji odpornościowych i metabolicznych. Drobnoustroje te nauczyły się dostosowywać do środowiska jakie proponują mu różne nisze na zewnątrz i wewnątrz naszego organizmu. A nasz organizm i jego układ odpornościowy w toku ewolucji zaczął rozróżniać tzw. dobre i złe mikroorganizmy – z jednymi współpracuje, a inne zwalcza.